பெப்டைட் தனிப்பயன் தொகுப்பில் பெப்டைட் பிணைப்பு உருவாக்கத்தின் கொள்கை எப்படி?

மேற்பரப்பில், பெப்டைட் பிணைப்புகளை உருவாக்குவது, டிபெப்டைட்களை விளைவிப்பது ஒரு எளிய இரசாயன செயல்முறையாகும்.இதன் பொருள் இரண்டு அமினோ அமிலக் கூறுகளும் நீரிழப்பு நிலையில் இருக்கும் போது ஒரு பெப்டைட் பிணைப்பு, ஒரு அமைடு பிணைப்பு மூலம் இணைக்கப்படுகின்றன.

பெப்டைட் பிணைப்பு உருவாக்கம் என்பது லேசான எதிர்வினை நிலைகளின் கீழ் ஒரு அமினோ அமிலத்தை செயல்படுத்துவதாகும்.(A) கார்பாக்சைல் பகுதி, இரண்டாவது அமினோ அமிலம் (B) நியூக்ளியோபிலிக் ஆக்டிவேட்டட் கார்பாக்சில் மொயட்டி பின்னர் டிபெப்டைடை (AB) உருவாக்குகிறது."கார்பாக்சில் கூறு (A) பாதுகாக்கப்படாவிட்டால், பெப்டைட் பிணைப்பின் உருவாக்கத்தை கட்டுப்படுத்த முடியாது."லீனியர் மற்றும் சைக்லிக் பெப்டைடுகள் போன்ற துணை தயாரிப்புகள் இலக்கு சேர்மங்களான AB உடன் கலக்கப்படலாம்.எனவே, பெப்டைட் பிணைப்பு உருவாக்கத்தில் ஈடுபடாத அனைத்து செயல்பாட்டுக் குழுக்களும் பெப்டைட் தொகுப்பின் போது தற்காலிகமாக மீளக்கூடிய முறையில் பாதுகாக்கப்பட வேண்டும்.

எனவே, பெப்டைட் தொகுப்பு - ஒவ்வொரு பெப்டைட் பிணைப்பின் உருவாக்கம் - திரட்டலின் மூன்று படிகளை உள்ளடக்கியது.

பாதுகாப்பு தேவைப்படும் சில அமினோ அமிலங்களை தயாரிப்பது முதல் படியாகும், மேலும் அமினோ அமிலங்களின் zwitterionic அமைப்பு இனி இல்லை.

இரண்டாவது படி பெப்டைட் பிணைப்புகளை உருவாக்குவதற்கான இரண்டு-படி எதிர்வினை ஆகும், இதில் N- பாதுகாக்கப்பட்ட அமினோ அமிலத்தின் கார்பாக்சைல் குழு முதலில் செயலில் உள்ள இடைநிலைக்கு செயல்படுத்தப்பட்டு பின்னர் பெப்டைட் பிணைப்பு உருவாகிறது.இந்த இணைந்த எதிர்வினை ஒரு-படி எதிர்வினையாகவோ அல்லது இரண்டு தொடர்ச்சியான எதிர்வினைகளாகவோ ஏற்படலாம்.

மூன்றாவது படி தேர்ந்தெடுக்கப்பட்ட நீக்கம் அல்லது பாதுகாப்பு தளத்தின் முழுமையான நீக்கம் ஆகும்.அனைத்து நீக்குதல்களும் அனைத்து பெப்டைட் சங்கிலிகள் கூடிய பின்னரே நிகழலாம் என்றாலும், பெப்டைட் தொகுப்பைத் தொடர பாதுகாப்பு குழுக்களைத் தேர்ந்தெடுத்து அகற்றுவதும் தேவைப்படுகிறது.

ஏனெனில் 10 அமினோ அமிலங்கள் (Ser, Thr, Tyr, Asp, Glu, Lys, Arg, His, Sec மற்றும் Cys) பக்க சங்கிலி செயல்பாட்டுக் குழுக்களைக் கொண்டிருக்கின்றன, அவை தேர்ந்தெடுக்கப்பட்ட பாதுகாப்பு தேவை, பெப்டைட் தொகுப்பை மிகவும் சிக்கலாக்குகிறது.தற்காலிக மற்றும் அரை-நிரந்தர பாதுகாப்புத் தளங்கள் தேர்ந்தெடுக்கப்படுவதற்கான வெவ்வேறு தேவைகள் காரணமாக வேறுபடுத்தப்பட வேண்டும்.அமினோ அமிலம் அல்லது கார்பாக்சைல் செயல்பாட்டுக் குழுக்களின் தற்காலிக பாதுகாப்பைப் பிரதிபலிக்க அடுத்த கட்டத்தில் தற்காலிக பாதுகாப்பு குழுக்கள் பயன்படுத்தப்படுகின்றன.அரை-நிரந்தர பாதுகாப்பு குழுக்கள் ஏற்கனவே உருவாக்கப்பட்ட பெப்டைட் பிணைப்புகள் அல்லது அமினோ அமில பக்க சங்கிலிகளில் குறுக்கிடாமல் அகற்றப்படுகின்றன, சில நேரங்களில் தொகுப்பின் போது.

"வெறுமனே, கார்பாக்சைல் கூறுகளை செயல்படுத்துதல் மற்றும் பெப்டைட் பிணைப்புகள் (இணைப்பு எதிர்வினைகள்) விரைவாக உருவாக்கப்பட வேண்டும், ரேஸ்மிக் அல்லது துணை தயாரிப்பு உருவாக்கம் இல்லாமல், அதிக மகசூலை அடைய மோலார் எதிர்வினைகள் பயன்படுத்தப்பட வேண்டும்."துரதிர்ஷ்டவசமாக, இரசாயன இணைப்பு முறைகள் எதுவும் இந்தத் தேவைகளைப் பூர்த்தி செய்யவில்லை, மேலும் சில நடைமுறை தொகுப்புக்கு ஏற்றவை.

பெப்டைட் தொகுப்பின் போது, ​​பல்வேறு எதிர்விளைவுகளில் ஈடுபடும் செயல்பாட்டுக் குழுக்கள் வழக்கமாக கையேடு மையத்துடன் இணைக்கப்படுகின்றன, கிளைசின் மட்டுமே விதிவிலக்காகும், மேலும் சுழற்சியின் அபாயமும் உள்ளது.

பெப்டைட் தொகுப்பு சுழற்சியின் இறுதி கட்டம் அனைத்து பாதுகாப்பு குழுக்களையும் அகற்றுவதாகும்.டிபெப்டைட் தொகுப்பில் பாதுகாப்பை முழுமையாக அகற்றுவதற்கான தேவைக்கு கூடுதலாக பெப்டைட் சங்கிலி நீட்டிப்புக்கு பாதுகாப்பு குழுக்களின் தேர்ந்தெடுக்கப்பட்ட நீக்கம் முக்கியமானது.செயற்கை உத்திகள் கவனமாக திட்டமிடப்பட வேண்டும்.மூலோபாயத் தேர்வைப் பொறுத்து, N ஆனது α-அமினோ அல்லது கார்பாக்சைல் பாதுகாக்கும் குழுக்களைத் தேர்ந்தெடுத்து நீக்கலாம்."வியூகம்" என்ற சொல் தனிப்பட்ட அமினோ அமிலங்களின் ஒடுக்க வினைகளின் வரிசையைக் குறிக்கிறது.பொதுவாக, படிப்படியான தொகுப்பு மற்றும் துண்டு ஒடுக்கம் ஆகியவற்றுக்கு இடையே வேறுபாடு உள்ளது.பெப்டைட் தொகுப்பு ("வழக்கமான தொகுப்பு" என்றும் அழைக்கப்படுகிறது) கரைசலில் நடைபெறுகிறது.பெரும்பாலான சந்தர்ப்பங்களில், பெப்டைட் சங்கிலியின் படிப்படியான நீளத்தை, குறுகிய துண்டுகளை ஒருங்கிணைக்க பெப்டைட் சங்கிலியைப் பயன்படுத்துவதன் மூலம் மட்டுமே ஒருங்கிணைக்க முடியும்.நீளமான பெப்டைட்களை ஒருங்கிணைக்க, இலக்கு மூலக்கூறுகள் பொருத்தமான துண்டுகளாகப் பிரிக்கப்பட வேண்டும் மற்றும் அவை C டெர்மினஸில் வேறுபாட்டின் அளவைக் குறைக்க முடியும் என்பதை தீர்மானிக்க வேண்டும்.தனித்தனி துண்டுகள் படிப்படியாக கூடிய பிறகு, இலக்கு கலவை இணைக்கப்படும்.பெப்டைட் தொகுப்பின் மூலோபாயம் சிறந்த மற்றும் மிகவும் பொருத்தமான பாதுகாப்பு துண்டின் தேர்வை உள்ளடக்கியது, மேலும் பெப்டைட் தொகுப்பின் மூலோபாயம் பாதுகாப்பு தளங்களின் மிகவும் பொருத்தமான கலவையின் தேர்வு மற்றும் துண்டு இணைப்பதற்கான சிறந்த முறை ஆகியவற்றை உள்ளடக்கியது.