வடிவமைப்பு திட்டம் மற்றும் பாலிபெப்டைட் பெப்டைட் சங்கிலியின் தீர்வு

I. சுருக்கம்
பெப்டைடுகள் சிறப்பு மேக்ரோமிகுலூல்கள் ஆகும், அவற்றின் வரிசைகள் அவற்றின் வேதியியல் மற்றும் உடல் அம்சங்களில் அசாதாரணமானவை.சில பெப்டைட்களை ஒருங்கிணைக்க கடினமாக உள்ளது, மற்றவை ஒருங்கிணைக்க ஒப்பீட்டளவில் எளிதானது ஆனால் சுத்திகரிக்க கடினமாக உள்ளது.நடைமுறைச் சிக்கல் என்னவென்றால், பெரும்பாலான பெப்டைடுகள் அக்வஸ் கரைசல்களில் சிறிதளவு கரையக்கூடியவை, எனவே நமது சுத்திகரிப்பு நடவடிக்கையில், ஹைட்ரோபோபிக் பெப்டைட்டின் தொடர்புடைய பகுதி நீர் அல்லாத கரைப்பான்களில் கரைக்கப்பட வேண்டும், எனவே, இந்த கரைப்பான்கள் அல்லது பஃபர்கள் பயன்பாட்டிற்கு கடுமையாக முரண்படும். உயிரியல் பரிசோதனை நடைமுறைகள், அதனால் தொழில்நுட்ப வல்லுநர்கள் தங்கள் சொந்த நோக்கங்களுக்காக பெப்டைடைப் பயன்படுத்துவதிலிருந்து கண்டிப்பாக தடைசெய்யப்பட்டுள்ளனர், இதனால் ஆராய்ச்சியாளர்களுக்கான பெப்டைட்களின் வடிவமைப்பில் பின்வருபவை பல அம்சங்களாகும்.

வடிவமைப்பு திட்டம் மற்றும் பாலிபெப்டைட் பெப்டைட் சங்கிலியின் தீர்வு
இரண்டாவதாக, செயற்கை கடினமான பெப்டைட்களின் சரியான தேர்வு
1. கீழ்-ஒழுங்குபடுத்தப்பட்ட வரிசைகளின் மொத்த நீளம்
15 க்கும் குறைவான எச்சங்கள் கொண்ட பெப்டைட்களை பெறுவது எளிதாக இருக்கும், ஏனெனில் பெப்டைட்டின் அளவு அதிகரிக்கிறது மற்றும் கச்சா உற்பத்தியின் தூய்மை குறைகிறது.பெப்டைட் சங்கிலியின் மொத்த நீளம் 20 எச்சங்களுக்கு அப்பால் அதிகரிப்பதால், துல்லியமான தயாரிப்பு அளவு முக்கிய கவலையாக உள்ளது.பல சோதனைகளில், எச்ச எண்ணை 20க்குக் கீழே குறைப்பதன் மூலம் எதிர்பாராத விளைவுகளைப் பெறுவது எளிது.
2. ஹைட்ரோபோபிக் எச்சங்களின் எண்ணிக்கையைக் குறைக்கவும்
ஹைட்ரோபோபிக் எச்சங்களின் அதிக ஆதிக்கம் கொண்ட பெப்டைடுகள், குறிப்பாக சி-டெர்மினஸில் இருந்து 7-12 எச்சங்கள் பகுதியில், பொதுவாக செயற்கை சிரமங்களை ஏற்படுத்துகின்றன.பி-மடிப்புத் தாள் தொகுப்பில் பெறப்பட்டதால், இது ஒரு போதிய கலவையாகத் துல்லியமாகக் காணப்படுகிறது."இதுபோன்ற சந்தர்ப்பங்களில், இரண்டுக்கும் மேற்பட்ட நேர்மறை மற்றும் எதிர்மறை எச்சங்களை மாற்றுவது அல்லது பெப்டைட் கலவையைத் திறக்க பெப்டைடில் கிளை அல்லது ப்ரோவை வைப்பது பயனுள்ளதாக இருக்கும்."
3. "கடினமான" எச்சங்களின் குறைப்பு
"சிஸ், மெட், ஆர்க் மற்றும் டிரை எச்சங்கள் பல உள்ளன, அவை பொதுவாக எளிதில் ஒருங்கிணைக்கப்படவில்லை."Ser பொதுவாக Cys க்கு ஆக்சிஜனேற்றமற்ற மாற்றாகப் பயன்படுத்தப்படும்.
வடிவமைப்பு திட்டம் மற்றும் பாலிபெப்டைட் பெப்டைட் சங்கிலியின் தீர்வு

மூன்றாவதாக, தண்ணீரில் கரையக்கூடிய சரியான தேர்வை மேம்படுத்தவும்
1. N அல்லது C டெர்மினஸைச் சரிசெய்யவும்
அமில பெப்டைட்களுடன் தொடர்புடையது (அதாவது, pH 7 இல் எதிர்மறையாக சார்ஜ் செய்யப்படுகிறது), அசிடைலேஷன் (N-டெர்மினஸ் அசிடைலேஷன், C டெர்மினஸ் எப்போதும் இலவச கார்பாக்சில் குழுவை பராமரிக்கிறது) எதிர்மறை கட்டணத்தை அதிகரிக்க பரிந்துரைக்கப்படுகிறது.இருப்பினும், அடிப்படை பெப்டைட்களுக்கு (அதாவது, pH 7 இல் நேர்மறையாக சார்ஜ் செய்யப்படுகிறது), அமினேஷன் (N-டெர்மினஸில் இலவச அமினோ குழு மற்றும் சி-டெர்மினஸில் அமினேஷன்) நேர்மறை கட்டணத்தை அதிகரிக்க பரிந்துரைக்கப்படுகிறது.

2. வரிசையை வெகுவாக சுருக்கவும் அல்லது நீட்டிக்கவும்

சில வரிசைகளில் Trp, Phe, Val, Ile, Leu, Met, Tyr மற்றும் Ala போன்ற அதிக எண்ணிக்கையிலான ஹைட்ரோஃபோபிக் அமினோ அமிலங்கள் உள்ளன. இந்த ஹைட்ரோபோபிக் எச்சங்கள் 50% ஐத் தாண்டினால், அவை பொதுவாக எளிதில் கரைவதில்லை.பெப்டைட்டின் நேர்மறை மற்றும் எதிர்மறை துருவங்களை மேலும் அதிகரிக்க வரிசையை நீட்டிப்பது பயனுள்ளதாக இருக்கும்.ஹைட்ரோபோபிக் எச்சங்களைக் குறைப்பதன் மூலம் நேர்மறை மற்றும் எதிர்மறை துருவங்களை அதிகரிக்க பெப்டைட் சங்கிலியின் அளவைக் குறைப்பது இரண்டாவது விருப்பம்.பெப்டைட் சங்கிலியின் நேர்மறை மற்றும் எதிர்மறை பக்கங்கள் வலிமையானவை, அது தண்ணீருடன் வினைபுரியும் வாய்ப்பு அதிகம்.
3. நீரில் கரையக்கூடிய எச்சத்தில் வைக்கவும்
சில பெப்டைட் சங்கிலிகளுக்கு, சில நேர்மறை மற்றும் எதிர்மறை அமினோ அமிலங்களின் கலவையானது நீரில் கரையும் தன்மையை மேம்படுத்தும்.அமில பெப்டைட்களின் N-டெர்மினஸ் அல்லது C-டெர்மினஸை குளு-குளுவுடன் இணைக்க எங்கள் நிறுவனம் பரிந்துரைக்கிறது.அடிப்படை பெப்டைட்டின் N அல்லது C டெர்மினஸ் கொடுக்கப்பட்டது, பின்னர் Lys-Lys.சார்ஜ் செய்யப்பட்ட குழுவை வைக்க முடியாவிட்டால், Ser-Gly-Ser ஐ N அல்லது C டெர்மினஸில் வைக்கலாம்.இருப்பினும், பெப்டைட் சங்கிலியின் பக்கங்களை மாற்ற முடியாதபோது இந்த அணுகுமுறை வேலை செய்யாது.