டிரான்ஸ்மேம்பிரேன் பெப்டைட்களின் கட்டமைப்பு பண்புகள் மற்றும் வகைப்பாடு

பல வகையான டிரான்ஸ்மேம்பிரேன் பெப்டைடுகள் உள்ளன, அவற்றின் வகைப்பாடு இயற்பியல் மற்றும் வேதியியல் பண்புகள், ஆதாரங்கள், உட்செலுத்துதல் வழிமுறைகள் மற்றும் உயிரியல் மருத்துவ பயன்பாடுகள் ஆகியவற்றின் அடிப்படையில் அமைந்துள்ளது.அவற்றின் இயற்பியல் மற்றும் வேதியியல் பண்புகளின்படி, சவ்வு ஊடுருவக்கூடிய பெப்டைட்களை மூன்று வகைகளாகப் பிரிக்கலாம்: கேஷனிக், ஆம்பிஃபிலிக் மற்றும் ஹைட்ரோபோபிக்.கேஷனிக் மற்றும் ஆம்பிஃபிலிக் சவ்வு ஊடுருவும் பெப்டைடுகள் 85% ஆகும், அதே நேரத்தில் ஹைட்ரோபோபிக் சவ்வு ஊடுருவக்கூடிய பெப்டைடுகள் 15% மட்டுமே.

1. கேஷனிக் சவ்வு ஊடுருவும் பெப்டைட்

கேஷனிக் டிரான்ஸ்மெம்பிரேன் பெப்டைடுகள் அர்ஜினைன், லைசின் மற்றும் ஹிஸ்டைடின், TAT, Penetratin, Polyarginine, P22N, DPV3 மற்றும் DPV6 போன்றவற்றில் நிறைந்துள்ள குறுகிய பெப்டைடுகளால் ஆனவை.அவற்றில், அர்ஜினைனில் குவானிடைன் உள்ளது, இது செல் சவ்வில் எதிர்மறையாக சார்ஜ் செய்யப்பட்ட பாஸ்போரிக் அமிலக் குழுக்களுடன் ஹைட்ரஜன் பிணைப்பு மற்றும் உடலியல் PH மதிப்பின் நிபந்தனையின் கீழ் டிரான்ஸ்மேம்பிரேன் பெப்டைட்களை சவ்வுக்குள் மத்தியஸ்தம் செய்யலாம்.ஒலிகார்ஜினைன் (3 R முதல் 12 R வரை) ஆய்வுகள், அர்ஜினைனின் அளவு 8 ஆகக் குறைவாக இருக்கும்போது மட்டுமே சவ்வு ஊடுருவல் திறன் அடையப்பட்டது, மேலும் அர்ஜினைனின் அளவு அதிகரிப்பதன் மூலம் சவ்வு ஊடுருவல் திறன் படிப்படியாக அதிகரித்தது.லைசின், அர்ஜினைன் போன்ற கேஷனிக் என்றாலும், குவானிடைனைக் கொண்டிருக்கவில்லை, எனவே அது தனியாக இருக்கும்போது, ​​அதன் சவ்வு ஊடுருவல் திறன் மிக அதிகமாக இருக்காது.ஃபுடாகி மற்றும் பலர்.(2001) கட்யானிக் செல் சவ்வு ஊடுருவும் பெப்டைடில் குறைந்தது 8 நேர்மறையாக சார்ஜ் செய்யப்பட்ட அமினோ அமிலங்கள் இருந்தால் மட்டுமே நல்ல சவ்வு ஊடுருவல் விளைவை அடைய முடியும் என்று கண்டறியப்பட்டது.ஊடுருவக்கூடிய பெப்டைடுகள் சவ்வுக்குள் ஊடுருவுவதற்கு நேர்மறையாக சார்ஜ் செய்யப்பட்ட அமினோ அமில எச்சங்கள் இன்றியமையாதவை என்றாலும், மற்ற அமினோ அமிலங்களும் சமமாக முக்கியம், அதாவது W14 F ஆக மாறும்போது, ​​பெனட்ராட்டினின் ஊடுருவல் இழக்கப்படுகிறது.

கேஷனிக் டிரான்ஸ்மேம்பிரேன் பெப்டைடுகளின் ஒரு சிறப்பு வகுப்பு அணுக்கரு பரவல் வரிசைகள் (NLSs) ஆகும், இது அர்ஜினைன், லைசின் மற்றும் ப்ரோலின் நிறைந்த குறுகிய பெப்டைட்களைக் கொண்டுள்ளது மற்றும் அணு துளை வளாகத்தின் மூலம் கருவுக்கு கொண்டு செல்லப்படலாம்.NLSகளை முறையே ஒன்று மற்றும் இரண்டு அடிப்படை அமினோ அமிலங்கள் கொண்ட ஒற்றை மற்றும் இரட்டை தட்டச்சு என பிரிக்கலாம்.எடுத்துக்காட்டாக, சிமியன் வைரஸ் 40(SV40) இலிருந்து PKKKRKV என்பது ஒரு ஒற்றைத் தட்டச்சு NLS ஆகும், அதே சமயம் அணுக்கரு புரதமானது இரட்டைத் தட்டச்சு NLS ஆகும்.KRPAATKKAGQAKKKL என்பது சவ்வு டிரான்ஸ்மேம்பிரனில் ஒரு பாத்திரத்தை வகிக்கக்கூடிய குறுகிய வரிசையாகும்.பெரும்பாலான NLSகள் சார்ஜ் எண்கள் 8 க்கும் குறைவாக இருப்பதால், NLSகள் பயனுள்ள டிரான்ஸ்மேம்பிரேன் பெப்டைடுகள் அல்ல, ஆனால் அவை ஹைட்ரோஃபோபிக் பெப்டைட் வரிசைகளுடன் இணைந்து ஆம்பிஃபிலிக் டிரான்ஸ்மேம்பிரேன் பெப்டைடுகளை உருவாக்கும்போது பயனுள்ள டிரான்ஸ்மேம்பிரேன் பெப்டைடுகளாக இருக்கும்.

கட்டமைப்பு-2

2. ஆம்பிஃபிலிக் டிரான்ஸ்மெம்பிரேன் பெப்டைட்

ஆம்பிஃபிலிக் டிரான்ஸ்மெம்பிரேன் பெப்டைடுகள் ஹைட்ரோஃபிலிக் மற்றும் ஹைட்ரோஃபோபிக் டொமைன்களைக் கொண்டிருக்கின்றன, அவை முதன்மை ஆம்பிஃபிலிக், இரண்டாம் நிலை α-ஹெலிகல் ஆம்பிஃபிலிக், β-மடிப்பு ஆம்பிஃபிலிக் மற்றும் புரோலின்-செறிவூட்டப்பட்ட ஆம்பிஃபிலிக் எனப் பிரிக்கப்படுகின்றன.

எம்பிஜி (GLAFLGFLGAAGSTMGAWSQPKKKRKV) மற்றும் Pep - 1 (KETWWETWTWKREWKVKVKV) ஆகிய இரண்டு வகைகளிலும் முதன்மை வகை ஆம்பிஃபிலிக் உடைகள் சவ்வு பெப்டைடுகள், NLSகளுடன் இணைந்த ஹைட்ரோபோபிக் பெப்டைட் வரிசை மூலம் இணைக்கப்பட்ட வகைகளாகும். இதில் ஹைட்ரோபோபிக் MPG இன் டொமைன் HIV கிளைகோபுரோட்டீன் 41 (GALFLGFLGAAGSTMG A) இன் இணைவு வரிசையுடன் தொடர்புடையது, மேலும் பெப்-1 இன் ஹைட்ரோபோபிக் டொமைன் உயர் சவ்வு இணைப்புடன் (KETWWET WWTEW) டிரிப்டோபான் நிறைந்த கிளஸ்டருடன் தொடர்புடையது.இருப்பினும், இரண்டின் ஹைட்ரோபோபிக் டொமைன்களும் WSQP மூலம் அணுக்கரு பரவல் சமிக்ஞை PKKKRKV உடன் இணைக்கப்பட்டுள்ளன.முதன்மை ஆம்பிஃபிலிக் டிரான்ஸ்மேம்பிரேன் பெப்டைட்களின் மற்றொரு வகை இயற்கை புரதங்களான pVEC, ARF(1-22) மற்றும் BPrPr(1-28) போன்றவற்றிலிருந்து தனிமைப்படுத்தப்பட்டது.

இரண்டாம் நிலை α- ஹெலிகல் ஆம்பிஃபிலிக் டிரான்ஸ்மேம்பிரேன் பெப்டைடுகள் α-ஹெலிஸ்கள் வழியாக சவ்வுடன் பிணைக்கப்படுகின்றன, மேலும் அவற்றின் ஹைட்ரோஃபிலிக் மற்றும் ஹைட்ரோபோபிக் அமினோ அமில எச்சங்கள் ஹெலிகல் கட்டமைப்பின் வெவ்வேறு பரப்புகளில் அமைந்துள்ளன, அதாவது MAP (KLALKLALK ALKAALKLA).பீட்டா பெப்டைட் மடிப்பு வகை ஆம்பிஃபிலிக் உடைகள் சவ்வுக்கு, பீட்டா மடிப்புத் தாளை உருவாக்கும் திறன் அதன் ஊடுருவல் திறனுக்கு முக்கியமானது, அதாவது VT5 (DPKGDPKGVTVTVTVTVTGKGDPKPD) போன்ற சவ்வுகளின் ஊடுருவல் திறனைப் பயன்படுத்தி ஆராய்ச்சி செய்யும் போது. - அமினோ அமிலம் பிறழ்வு ஒப்புமைகள் பீட்டா மடிந்த துண்டுகளை உருவாக்க முடியாது, சவ்வு ஊடுருவல் திறன் மிகவும் மோசமாக உள்ளது.ப்ரோலின்-செறிவூட்டப்பட்ட ஆம்பிஃபிலிக் டிரான்ஸ்மேம்பிரேன் பெப்டைடுகளில், பாலிபெப்டைட் அமைப்பில் புரோலின் அதிக அளவில் செறிவூட்டப்படும்போது, ​​தூய நீரில் பாலிப்ரோலின் II (பிபிஐஐ) எளிதில் உருவாகிறது.PPII என்பது ஒரு முறைக்கு 3.0 அமினோ அமில எச்சங்களைக் கொண்ட இடது கை ஹெலிக்ஸ் ஆகும், இது ஒரு முறைக்கு 3.6 அமினோ அமில எச்சங்களைக் கொண்ட நிலையான வலது கை ஆல்பா-ஹெலிக்ஸ் கட்டமைப்பிற்கு மாறாக உள்ளது.புரோலைன்-செறிவூட்டப்பட்ட ஆம்பிஃபிலிக் டிரான்ஸ்மேம்பிரேன் பெப்டைட்களில் போவின் ஆண்டிமைக்ரோபியல் பெப்டைட் 7(Bac7), செயற்கை பாலிபெப்டைட் (PPR)n(n 3, 4, 5 மற்றும் 6) போன்றவை அடங்கும்.

கட்டமைப்பு-3

3. ஹைட்ரோபோபிக் சவ்வு ஊடுருவும் பெப்டைட்

ஹைட்ரோபோபிக் டிரான்ஸ்மேம்பிரேன் பெப்டைடுகள் துருவமற்ற அமினோ அமில எச்சங்களை மட்டுமே கொண்டிருக்கின்றன, அமினோ அமில வரிசையின் மொத்த கட்டணத்தில் 20% க்கும் குறைவான நிகர கட்டணம் அல்லது டிரான்ஸ்மேம்பிரனுக்கு அவசியமான ஹைட்ரோபோபிக் பகுதிகள் அல்லது இரசாயன குழுக்களைக் கொண்டுள்ளது.இந்த செல்லுலார் டிரான்ஸ்மெம்பிரேன் பெப்டைடுகள் பெரும்பாலும் கவனிக்கப்படுவதில்லை என்றாலும், அவை ஃபைப்ரோபிளாஸ்ட் வளர்ச்சி காரணி (K-FGF) மற்றும் கபோசியின் சர்கோமாவிலிருந்து ஃபைப்ரோபிளாஸ்ட் வளர்ச்சி காரணி 12 (F-GF12) போன்றவை உள்ளன.


இடுகை நேரம்: மார்ச்-19-2023